Метагеномы крови и псориатической кожи. Проект исследования

 

Песляк Михаил Юрьевич, Короткий Николай Гаврилович.

 

Аннотация

 

Выполнено обоснование и подробное описание первого этапа проекта, посвященного изучению, диагностике и лечению псориаза. Целью первого этапа является проверка базовых гипотез новой системной YN-модели патогенеза псориаза. Проверка представляет собой комплексное изучение метагенома цельной крови и метагенома (фагоцитов) псориатической кожи. Метагеном это вся нехозяйская DNA (здесь – не принадлежащая человеку), содержащаяся в биоматериале. Предложены и обоснованы алгоритмы, необходимые для комплексного изучения метагеномов.

 

Проведена обзорно-аналитическая оценка результатов основных работ по изучению метагеномов крови и кожи. Выполнен аналитический обзор всех (опубликованных до начала 2019 года) работ по определению концентрации бактериальной DNA в цельной крови здоровых людей.

 

Выполнено детальное сравнение характеристик 16S-теста и WMS-теста.

 

Сформулированы цели и задачи (включая порядок их решения) первого этапа.

 

Поставлены основные вопросы, на которые по итогам первого этапа должны быть получены ответы. Предложен порядок подготовки и выполнения WMS-теста цельной крови.

 

Проведено детальное сравнение YN-модели патогенеза с ранее опубликованной Y-моделью. Выполнен аналитический обзор работ, посвященных изучению привлечения нейтрофилов крови в псориатическую кожу и последующего их возможного нетоза. Нетоз в псориатической коже нейтрофилов, являющихся носителями эндоцитированного в крови Y-антигена, назван необходимым звеном порочного цикла псориатического воспаления в рамках YN-модели. Предложена классификация псориатической болезни как нетопатии.

 

Дано определение псорагенных бактерий, основанное на наличии генов, ответственных за формирование межпептидных мостиков. Определены наименьшие пептиды (фрагменты пептидогликана) – потенциальные Y-антигены.

 

Иллюстрации выполнены в виде презентации и находятся в дополнительном файле (перечень всех дополнительных файлов в разделе 5.12).

 

Download
Метагеномы крови и псориатической кожи. Проект исследования
Метагеномы крови и псориатической кожи. Проект исследования
5 Metagenomes_of_blood_and_psoriatic_ski
Adobe Acrobat Document 1.4 MB